次氯酸钠的消毒效果好、投加准确、操作安全、使用方便，对环境无毒害，不存在跑气、泄漏情况，可以任意环境工作状况下投加次氯酸钠。次氯酸钠能破坏氰根离子、苯环等，用作处理含氰废水与一些工业重度污染废水的高级氧化，同时可以用在纸浆等中漂白。高浓度的次氯酸钠液体能用于剥离设备、管道上附着的沾泥。次氯酸钠溶液价格的灭菌原理是通过水解形成的次氯酸，次氯酸再进一步分解就形成了新生态的氧，新生态氧的极强氧化性使得菌体与病毒的蛋白质发生变性，从而使病源微生物发生致死。氯气消毒的原理是以产生出次氯酸的方式实现的。次氯酸钠同氨可以发生反应，在水中生成微量的氯氨化合物，但这种物质是比较安全的杀生药剂，远不及次氯酸钠的实际杀菌能力。由于次氯酸钠液不容易久存，多以电解低浓度食盐水现场来制备。次氯酸钠溶液的价格具有明显的优势。作为一种真正高效安全的强力灭菌和杀病毒药剂，它同水的亲和性非常好，能与水任意进行比互相溶，它不存在如同液氯、二氧化氯等药剂的安全隐患，且消毒效果被公认为与氯气是相当的。因此次氯酸钠溶液被广泛用在包括自来水、工业循环水、游泳池水和医院污水等等各种水体中进行消毒。