次氯酸钠使用和储存时的注意事项是冲洗时不能加压，针头不要堵住根管，以免溶液超出根尖孔，从而损伤根尖周围组织。为了使药液达到根尖标准处的根管，应该在根管预备充分通畅之后使用。次氯酸钠应新鲜配制，避光、避热及密闭保存，次氯酸钠的浓度高时对黏膜有刺激。实际操作注意进行密闭的操作，全面进行通风。次氯酸钠操作人员须经过专门的培训，严格的遵守操作规程。同时建议操作人员佩戴直接式的防毒面具，这样戴化学安全防护的眼镜，穿上防腐工作服，戴上橡胶手套。防止蒸气泄漏到工作场的空气中。以避免与酸类接触的效果。次氯酸钠搬运时要轻装轻卸，防止发生包装及容器损坏的现象。实现配备泄漏应急处理设备，从而倒空的容器可能发生残留的有害物。次氯酸钠包装方法是用耐酸坛或是陶瓷瓶外普通木箱、半花格的木箱，若是发生泄漏应急处理的方法是迅速撤离泄漏污染区人员到安全区，并进行全面隔离，严格限制人员出入。通常建议应急处理人员戴自给正压式的呼吸器，穿上防酸碱工作服。不能直接接触泄漏物。尽可能的切断泄漏源。次氯酸钠小量泄漏，一般用砂土、蛭石或是其它的惰性材料吸收。次氯酸钠大量泄漏，这样构筑围堤或是挖坑收容。通常用泡沫覆盖，降低蒸气的灾害，实现回收或是运至废物处理场所进行处置。