次氯酸钠属于高效的含氯消毒剂。含氯消毒剂的杀菌作用包括次氯酸的作用、新生氧作用与氯化作用。次氯酸的氧化作用是含氯消毒剂的主要的杀菌机理。含氯消毒剂在水中形成次氯酸，作用于菌体蛋白质。次氯酸不仅可与细胞壁发生作用，且因分子小，不带电荷，故侵入细胞内与蛋白质发生氧化作用或破坏其磷酸脱氢酶，使糖代谢失调而致细胞死亡。R-NH-R HC10-RNC H2O（细菌蛋白质），次氯酸钠的浓度越高，杀菌作用越强。而次氯酸钠在水中能解离为次氯酸NAC10 H2O-NAOH HC10所以说次氯酸钠溶液是一种高效的消毒液。影响次氯酸钠杀菌作用的因素：①、PH：PH值对次氯酸钠杀菌作用影响较大。PH值愈高，次氯酸钠的杀菌作用愈弱，PH值降低，其杀菌作用增强。②、浓度：在PH、温度、有机物等不变的情况下，有效氯浓度增加，杀菌作用增强。③、温度：在一定范围内，温度的升高能增强杀菌作用，此现象在浓度较低时较明显。④、有机物：有机物能消耗有效氯，降低其杀菌效能。⑤、水的硬度：水中的CA 、MG 等离子对次氯酸盐溶液的杀菌作用没有任何影响。⑥、氨和氨基化合物：在含有氨和氨基化合物的水中，游离氯的杀菌作用大大降低。⑦、碘或嗅：在氯溶液中加入少量的碘或臭可明显增强其杀菌作用。⑧、硫化物：硫代硫酸盐和亚铁盐类可降低氯消毒剂的杀菌作用。